叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
玉石部上品丹砂玉泉玉屑云母石钟乳朴硝芒硝硝石玄明粉生硝矾石滑石空青曾青石胆绿青赤石脂白石脂青石脂黑石脂黄石脂白石英紫石英禹余粮太一余粮无名异绿矾柳絮矾婆娑石中品雄黄石硫黄雌黄食盐水银石膏金屑银屑生银灵
引凡例卷一上五脏六腑仰人尺寸（图缺）伏人尺寸（图缺）手足阴阳流注中指同身寸法手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经卷一下足少阴肾经手厥阴心包络经手少阳三焦经足少阳
前言正文感冒主症病因病机辨证施治康复调理饮食调治防治要点慢性支气管炎主症病因病机辨证施治康复调理饮食调治防治要点肺原性心脏病主症病因病机辨证施治康复调理饮食调治防治要点冠心病主症病因病机辨证施治康复调
太阳证发热（长期低热）太阳证偏头痛（三叉神经痛）太阳证眩晕（美尼尔氏综合症）太阳证咳嗽支气管扩张急性肺炎太阳证哮喘太阳证刚痉（临产麻疹）太阳证柔痉太阳证风湿太阳证历节病（风湿性关节炎）太阳证风寒湿痹风
锲斗垣申君校正外科启玄序序校正外科启玄自序外科启玄附痘科序后序卷之一明疮疡标本论明疮疡脉理论明疮疡是阴阳相滞论明疮疡分五善七恶论明疮疡原无定处论明疮疡色脉形症当参相应论明疮疡部位所属经络论明疮疡生十二
自序新刻难经悬解叙卷上一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九难三十难
序凡例卷上温病总论伤寒温病辨（四则）风温上焦篇风温中焦篇风温下焦篇卷下湿温上焦篇湿温中焦篇湿温下焦篇附温病治法要略附方
导言五菜药解韭菜葱薤（蒜苗）葵藿五谷药解粳米小麦大豆黍米(又称糯小米、黄米)芝麻(又名胡麻、脂麻)五果药解杏李桃栗枣五畜药解猪肉牛肉羊肉鸡肉狗肉
提要看症口诀四季口诀大寒小寒七香跌打丸跌打总方回生丹跌打吊瘀煎水洗方