幼科发微赋卷之一十三科预养以培其元一胎养以保其真二蓐养以防其变三回气捷法拭口时法浴儿法断脐法嗜儿法刮泡法通便法贴囟法牛黄法鞠养以防其疾四辨小儿寿夭辨小儿形色辨小儿脉息辨小儿脉证治五脏证治总论肝脏证治心
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
黄帝内经素问遗篇
简介序卷一卷二卷三卷四附
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻
痎疟论疏
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
自序小序凡例卷之一冬伤于寒春必病温大意春温风温温病温毒晚发拟用诸法备用成方临证治案卷之二春伤于风大意伤风冒风中风风寒风热风湿寒疫拟用诸法备用成方临证治案卷之三春伤于风夏生飧泄大意飧泄洞泄寒泻火泻暑泻湿
自序白苔舌总论黄苔舌总论黑苔舌总论灰色舌总论红色舌总论紫色舌总论霉酱色苔舌总论蓝色苔舌总论妊娠伤寒舌总论